Задачей отдела по организации педиатрической и акушерско-гинекологической помощи министерства здравоохранения Красноярского края,  является организация деятельности министерства по:

1. осуществлению управления в установленном порядке краевыми государственными учреждениями здравоохранения в части организации оказания ими медицинской помощи гражданам;
2. осуществлению реализации целевых программ в случаях, установленных федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации, законами края, правовыми актами Губернатора края и Совета администрации края, соглашениями между федеральными органами исполнительной власти и Советом администрации края о передаче осуществления части полномочий;
3. осуществлению реализации среднесрочных планов развития сферы здравоохранения;
4. реализации мероприятий по охране семьи, материнства, отцовства и детства;
5. организации и осуществлению контроля в установленном порядке за обеспечением детей первого и второго года жизни из семей со среднедушевым доходом ниже величины прожиточного минимума, установленного по соответствующей группе территорий края на душу населения, специальными молочными продуктами детского питания в учреждениях здравоохранения края;
6. организации и осуществлению контроля в установленном порядке за приемом, выхаживанием и содержанием детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей или иных законных представителей, в возрасте до 4 лет в учреждениях здравоохранения края;
7. организации системы контроля за соблюдением стандартов медицинской помощи, оказываемой краевыми государственными учреждениями здравоохранения.
8. направлению граждан Российской Федерации, проживающих на территории края, в учреждения здравоохранения федерального подчинения для получения дорогостоящей (высокотехнологичной) медицинской помощи за счет средств федерального бюджета в установленном порядке;
9. направлению граждан Российской Федерации, проживающих на территории края, в организации здравоохранения, расположенные за пределами края, для получения медицинских услуг, в том числе дорогостоящей (высокотехнологичной) медицинской помощи, за счет средств краевого бюджета.